查尔斯达尔文大学有11个大学研究中心，包括：亚太文学研究中心，医学护理研究，能源研究，文化资源研究，社会研究，东南亚法律，东南亚研究，教育语言研究，多元教育背景的教育与学习，热带环境建筑，热带湿地研究。
专业设置
查尔斯达尔文大学工程荣誉学士和工程科学学士均设有以下4个专业方向，分别是：
化学工程（Chemical Engineering）
土木工程（Civil Engineering）
电气与电子工程（Electrical and Electronics Engineering）
机械工程（Mechanical Engineering）