有8个学院：文理学院（学士和硕士），商学院，职业心理研究所（硕士和博士），工程学院（学士和硕士），圣保罗神学院（硕士和博士），教育学院（学士、硕士、专家和博士），法律学院（法学博士），社会工作学院（学士和硕士）
美国圣托马斯大学班级设置
平均班级人数21人（本科），19人（硕士）。师生比例：1：14。
美国圣托马斯大学具体专业提供
本科：
文科类---能提供所有的文科类的课程，尤其在商科、传媒和教育方面的课程设计范围广泛，专业实践性很强。
理科类--- 保险统计学，生物化学，化学，经济学，电子工程，体育健康促进 – 科学重点，物理学，机械工程
硕士：开设的专业共有46门， 其中包括39门硕士课程，2个教育专家，一个法学博士和4个博士头衔。