巴克纳尔大学有两个学院——艺术与科学学院，工程学院。为学生提供53门主修课程，64门辅修课程。除此之外，还为学生提供其他相关课程，包括统计与管理学，教育学，声乐。以及职前教育课程，包括法学和医药学。该大学的28个科系都本着提供最优质的教学质量的态度给学生提供教育。
艺术及科学学院－按照传统的分支方法，将课程分为人文学，社会科学，自然科学和数学三大部分。
工程学院——该学院主要提供六个专业方向的课程，包括生物医学工程，化学工程，城市与环境工程，电子工程，医药工程和计算机科学。
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